Clio Der Sarkissian est chargée de recherche CNRS (CRCN) et membre de l’équipe AGES.
Ses recherches antérieures et en cours se sont concentrées sur l’utilisation de la génomique et de la métagénomique anciennes pour retracer l’histoire de diverses populations, espèces et communautés, telles que les humains anciens, les chevaux, les mollusques, mais aussi des agents pathogènes et microbiotes.
Son objectif actuel est de développer des approches multidisciplinaires, combinant archéologie, zooarchéologie, imagerie 3D, morphométrie, mathématiques, biologie moléculaire, génomique des populations, écologie, reconstruction de paléo-environnements…
Elle est particulièrement impliquée dans le développement des analyses des coquilles de mollusques en tant qu’objets scientifiques multi-proxy par des approches de génomique (ancienne), morphologie et écologie environnementale. Ces travaux s’appuient sur des découverte précédentes de Clio et ses collègues montrant que les collections de coquilles de mollusques peuvent servir d’archives métagénomiques pour les 100 000 dernières années, et potentiellement au-delà. Ses recherches portent sur l’étude à haute résolution des relations entre les réponses phénotypiques et génomiques des mollusques aux changements environnementaux, à de multiples échelles géographiques et temporelles, et à divers niveaux d’anthropisation. Son intérêt est motivé par la préoccupation croissante des sociétés face aux changements environnementaux globaux actuels et à leurs conséquences néfastes sur la biodiversité.
Elle est coordinatrice du projet CNRS MITI X-Shell et du projet ANR JCJC MEET.
Elle est membre à la fois du comité d’organisation et du comité scientifique du workshop en ligne Standards Precautions and Advances in Metagenomics (SPAAM2 ; 21-22 septembre 2020 ; 60+ participants), ainsi que du 9ème International Symposium on Biomolecular Archaeology (ISBA9).
Court CV
- Octobre 2019-présent : Chargée de recherche CNRS (CRCN) à l’UMR5288
- 2017-2019 : Post-doctorante Marie Skłodowska-Curie à l’UMR5288
- 2014-2017 : Professeure assistante au Center for GeoGenetics, Museum d’Histoire Naturelle du Danemark, Université de Copenhague, Danemark
- 2012-2014 : Post-doctorante au Center for GeoGenetics, Museum d’Histoire Naturelle du Danemark, Université de Copenhague, Danemark
- 2008-2011 : Doctorante à l’Australian Center for Ancient DNA, Université d’Adélaïde, Australie
Quelques séminaires
- 1er Déc 2018 : 39ème conférence de l’Association for Environmental Archaeology, Moesgaard Museum et Department of Archaeology & Heritage Studies, Université d’Aarhus University, Danemark
- 20 Sep 2018 : 8ème International Symposium on Biomolecular Archeology à Iéna, Allemagne
- 2018-2021: Cafés Femmes en Sciences par l’association Femmes & Sciences et la DR14-Occitanie Ouest du CNRS, Café du Quai, Musée Quai des Savoirs, Toulouse
Publications sélectionnées
- Der Sarkissian et al. 2020. Unveiling the Ecological Applications of Ancient DNA From Mollusk Shells. Frontiers in Ecology and Evolution 8.
- Der Sarkissian et al. 2017. Ancient DNA reveals marine mollusc shells as new metagenomic archives of the past. Molecular Ecology Resources 17:835-853.
- Louvel*, Der Sarkissian* et al. 2016. metaBIT, an integrative and automated metagenomic pipeline for analysing microbial profiles from high-throughput sequencing shotgun data. Molecular Ecology Resources 16:1415-1427.
- Der Sarkissian et al. 2015. Evolutionary Genomics and Conservation of the Endangered Przewalski’s Horse. Current Biology 25:2577–2583.
- Librado*, Der Sarkissian* et al. 2015. Tracking the origins of Yakutian horses and the genetic basis for their fast adaptation to subarctic environments. PNAS 112:E6889-6897.
Couverture médiatique
- Anne-Claire Jolivet. 12 mai 2021. Portrait d’une paléogénomicienne, avec Clio Der Sarkissian. Exploreur